La Congregación Siervas del Santísimo y de la Caridad fundada por la Sierva de Dios Madre María Jesús Upegui con sede principal en Medellín envía a sus primeras religiosas a la ciudad de Cali en el año 1955 para prestar sus servicios en el Instituto Claret, propiedad de los padres claretianos, contando con 120 niñas.
1957. Mediante la resolución 3287 del 10 de septiembre del El mismo año se otorga la licencia de funcionamiento al Instituto. Claret, dirigido por la reverenda hermana Felipa de la Inmaculada (Mariela Restrepo) para ofrecer un curso de Secretariado comercial.
1958. Mediante la resolución 01452 del 15 de abril del mismo año se sustituyó el curso de Secretariado Comercial por el curso de Experto en Comercio. Se Aprobaron bajo la Resolución 1631 del MEN los primeros años (1º y 2º) del estudio. del curso de Experto en Comercio. Antes de iniciar el año lectivo 1958-1959, las Hermanas Josefina Jaramillo, Mariela Borja, Alicia Franco y Amantina Carmona se Trasladan a la Cra. 27 Sur N.º 9C-47 del barrio Champagnat para empezar con autonomía la labor educativa dando nacimiento al colegio San José. 1959.
Mediante la Resolución 2086 del 19 de mayo de este año Se aprueban los tres primeros cursos de Experto en Comercio. El 4 de junio, mediante resolución 2420, se Concede licencia de funcionamiento y se autoriza iniciar. el primer ciclo de bachillerato. El 6 de noviembre, Mediante la Resolución 5436, se autoriza a la rectora el Cambio de nombre del colegio y se aprueba el curso de Experto en Comercio. La La resolución 5575 del 13 de noviembre confirma el nombre oficial de Colegio San José de Caldas.
1960. Mediante la Resolución 3405 del 7 de julio, el MEN aprueba el curso regular. de Experto en Comercio, labor muy bien desarrollada por la madre Mariela. Restrepo.
1961. Se perfila el ciclo de educación clásica mediante la resolución 0866 del 23 de marzo.
1962. Mediante la resolución 0813 del 22 de marzo se aprueban los cursos de 1.° a 4.° de bachillerato y la resolución 1812 del 21 de mayo aprueba los estudios de bachillerato en el colegio.
1964. Se aprueba los estudios de 1.° a 6.° de bachillerato y se autoriza expedir título de bachiller.
1966. Se aprueban los estudios correspondientes a los cursos de 1.°, 2.°, 3.° y 4.°. del ciclo básico de enseñanza comercial mediante resolución del 5 de agosto.
1967. Mediante la Resolución 1193 del 22 de mayo se Aprueban los estudios realizados en el colegio y se autoriza a Expedir diplomas de bachillerato comercial.
1968. Se ratifica la expedición de diplomas y certificados. mediante la Resolución 3572 del 31 de octubre.
1982. Se amplía la cobertura del servicio educativo. trasladando las secciones del ciclo de educación básica secundaria y media vocacional a la sede del barrio El Refugio, mejorando el servicio. A partir de entonces se descentraliza la institución en dos secciones: preescolar y primaria, y básica secundaria y media académica.
2007. Se inicia el proceso de certificación de calidad con ISO 9001-2001, siendo Rectora: la hermana Amparo Duque.
2008. Se realiza la auditoría externa por parte del Icontec.
2009. Se recibe el certificado de Icontec e IQNet, siendo rectora la hermana. Amparo Duque.
2010. Nuevamente el colegio recibe auditoría externa del Icontec, resultando acreditada y certificada por un año más.
2014. Se inicia el proceso de formación, en articulación con el SENA, para aprobación de la Media Técnica en Contabilización de Operaciones Comerciales  Financieras para las jóvenes de los grados 10º y 11º. Este año las estudiantes Inician el pénsum académico de la media técnica.
2015. El colegio continúa laborando con criterios bien definidos en un proceso de educación permanente humano-cristiana con la comunidad educativa, a través de juventudes nuevas, fermento del Evangelio y agentes del cambio para la sociedad.
2016. El colegio San José – Champagnat se convierte en un colegio mixto en sus niveles académicos preescolar, básica primaria, básica secundaria y media técnica, brindando una formación integral continua.